Лаборатория генетики и эволюции бобовых растений

Институтa цитологии и генетики

Ранее - Сектор экспериментального моделирования эволюционных процессов

В 1988 г. коллектив, руководимый В.А. Бердниковым, выделился из лаборатории эволюционной генетики в самостоятельную группу молекулярных механизмов эволюции и селекции. В 1990 г. группа была преобразована в лабораторию Экспериментального моделирования эволюционных процессов. Выделение коллектива последовало вскоре после того, как логика его научной работы привела к смене объекта и характера экспериментальной деятельности. Если раньше проводились в основном сравнительно-биохимические исследования различных групп животных и растений, то к 1985 году коллектив сосредоточился на генетической работе с горохом посевным.

Первоначально основной задачей коллектива было изучение возможной роли лизин-богатых гистонов в функционировании хроматина in vivo, однако со временем внимание было сосредоточено на исследовании изменчивости молекул гистонов Н1 и Н5, ее размаха, закономерностей и возможного эволюционного значения. Полученные в лаборатории свидетельства адаптивного характера межвидовой изменчивости этих белков и результаты исследования внутривидового полиморфизма по ним показали, что изменения в молекуле Н1 может оказывать мягкое плейотропное влияние на фенотип организма. Сформулированное предположение о том, что гены гистона Н1 могут быть вовлечены в разнообразные адаптивные процессы в качестве полигенов общего действия определили обращение лаборатории к проблемам теории эволюции. В результате В.А. Бердниковыми была предложена теория, делающая попытку объяснить причины и динамику макроэволюционных тенденций, традиционно называемых прогрессивными. Под действием этого обращения к теории была сформулирована новая стратегическая цель исследований - создание генетических конструкций, обеспечивающих высокий уровень изменчивости по многим количественным признакам (в частности, создание искусственной В-хромосомы), с помощью которых можно воспроизвести реальные эволоюционные процессы, но с гораздо большей скоростью, допускающей экспериментальное исследование. Это определило переориентацию лаборатории на генетическую работу с посевным горохом, в которой главное место отводится хромосомной инженерии с использованием структурных перестроек кариотипа, леталей и биохимических маркеров. В ходе этой работы создаются удобные конструкции, подобные применяющимся в генетике дрозофилы.

Были получены свидетельства в пользу существования адаптивной составляющей межвидовой изменчивости гистона Н5 у птиц и Н1 у насекомых и выявлены случаи внутривидового полиморфизма по этим белкам. Особенно высокий уровень полиморфизма по гистону Н1 был найден у бобовых растений, что дало уникальную возможность исследования влияния изменения молекулы этого белка на фенотип и приспособленность организма. Изучены закономерности географического распространения аллелей у горошка однопарного, чины посевной и гороха посевного, в котором найдены свидетельства действия на них естественного отбора. Прямые опыты по сравнению специально созданных изогенных линий гороха, различающихся лишь очень небольшими участками генома, содержащими разные аллели генов Н1, показали, что аллельные замещения в них оказывают небольшое, но значимое влияние на ряд количественных признаков. В ходе генетической работы с горохом был сделан значительный вклад в частную генетику этого важного сельскохозяйственного объекта: индуцирован и локализован ряд новых мутаций и существенно пересмотрена генетическая карта, которая пока еще находится в процессе становления. Синтезировано несколько генетических конструкций, позволяющих проводить тонкие генетическиа эксперименты.

В лаборатории предложена теория мобилизующего отбора, действующего на межвидовом уровне и обуславливающего прогрессивные макроэволюционные тенденции.


В 2005 г. заведующий лаборатории В.А. Бердников вышел на пенсию, а ее название изменено на "Лаборатория генетики и селекции бобовых растений". К этому моменту в лаборатории были получены следующие результаты:

  1. Был практически завершен более чем двадцатипятилетний цикл оригинальных исследований влияния молекулярных изменений гистона Н1 на фенотипические признаки и роли изменчивости этого белка в адаптивной эволюции. Была разработана модель для исследования фенотипических эффектов замещения аллельных вариантов гистона Н1, представляющая собой нескольких наборов изогенных линий посевного гороха, а также посевной чины и обыкновенной чечевицы. Было исследовано три таких набора. Во-первых, проведено сравнение пары изогенных линий чечевицы, различающихся аллельными вариантами наиболее мощного субтипа 1, причем один из них возник вследствие недавней мутации. Были выявлены небольшие, но достоверные различия по многим количественным признакам. Во-вторых, в нескольких широкомасштабных экспериментах исследовалось влияние замещений аллельных вариантов самого электрофоретически мобильного субтипа Н1 на количественные признаки растения. Характерная особенность этого субтипа состоит в том, что он присутствует только в молодых, активно растущих тканях. Было обнаружено, что эти замещения значимо влияют прежде всего на скорость роста растений, тогда как эффект на дефинитивные признаки гораздо слабее. В-третьих, показано отсутствие влияния замещений в локусе субтипа 1 гистона Н1 на проявление слабого аллеля гомеозисного гена Unitac, понижающего уровень ветвления сложного листа, тогда как ранее мы обнаружили существенный эффект этих замещений (около 20%) на проявление другого гомеозисного гена, Tl, в гемизиготе. Эти результаты свидетельствуют об избирательности эффекта структурных изменений молекулы гистона Н1.

    У трех субтипов гистона Н1 гороха была расшифрована нуклеотидная последовательность аллелей. Различия между аллельными вариантами связаны с заменами аминокислот, а также делециями/дупликациями. Выяснилось, что при формировании аллелей субтипа 1 гороха и чечевицы важную роль играла внутригенная конверсия специфических гексапептидных повторов С-терминального домена молекулы.

     

  2. Предложена новая гипотеза о формировании В-хромосом у растений через стадию третичной трисомии, за счет компенсации гаметофитных леталей дополнительной хромосомой транслокационного происхождения. Предполагается, что процесс сопровождается естественым отбором на снижение генного дисбаланса и повышение вероятности передачи дополнительной хромосомы гаметами. В ходе проверки гипотезы была разработана уникальная экспериментальная модель, представляющая собой серию стабильных трисомных линий посевного гороха, несущих дополнительную минихромосому, происходящую из транслокации Хаммарлунда - старейшей транслокации в истории генетики. В одной из линий, потомство которой представлено исключительно трисомиками, проведен отбор на повышение плодовитости, в результате которого наблюдался значительный ответ как по селектируемому признаку, так и по общей жизненности растений, что можно интерпретировать как отбор спонтанных мутаций, уменьшающих генный дисбаланс. Дальнейшее сокращение генетического содержания минихромосомы путем экспериментального мутагенеза и отбора может превратить ее в удобный хромосомный вектор для генетической трансформации гороха. Его можно будет использовать для накопления хозяйственно значимых трансгенов, после чего одномоментно передавать их единым блоком в другие генотипы путем скрещивания и короткого периода бэккросса. Кроме того ожидается, что оптимальная доза дополнительной хромосомы в геноме будет легко регулироваться естественным отбором в ходе эксплуатации сорта.

     

  3. Проведена попытка реконструкции генетической системы, контролирующей развитие сложного листа гороха. Показано, что "исходным состоянием" (ground state) для него является дваждыперистый лист, подобный листу примитивных семейств бобоцветных, а многочисленные регуляторные гены, контролирующие архитектонику листа гороха, направлены на снижение уровня ветвления и преобразование части листочков в специализированные опорные структуры - усики. В ходе данных исслеодваний путем экспериментального мутагенеза были получены и охарактеризованы более десятка новых мутаций и несколько новых гомеозисных генов, участвующих в генетическом контроле сложного листа. Особо следует отметить гены ins2 и tl2. Ген Ins2 является синергистом известного гена Afila и антагонистом гена Unifoliata. Характерной особенностью мутации ins2 является мягкое и варьирующее в пределах растения фенотипическое проявление. Это позволяет получить серию переходов между различными структурами листочков и прилистников, что, в сочетании с известными ранее мутациями, проясняет их гомологию и паттерны экспрессии различных генов, контролирующих развитие листа. Мутация tl2 уникальна в том отношении, что оказывает эффект на морфологию листа только в гетерозиготном состоянии, приводя к появлению тонкой ламины вдоль усиков (фенотип, аналогичный гетерозиготе по ранее известному гену tl/Tl), а в гомозиготе неотличима от нормы. В то же время, в гомозиготе она оказывает эффект на окраску венчика, делая ее зеленоватой. Высказано предположение о вовлечении гена Tl2 в программу развития сложного листа из системы генетического контроля синтеза антоциана.

     


В настоящее время (начало 2023 г.) основные исследования лаборатории сосредоточены на двух направлениях:

  1. Изучение генетических основ конфликта ядра и цитоплазмы в отдаленных скрещиваниях гороха участием диких представителей рода Горох Все представители рода этого способны к скрещиваниям между собой, однако в отдаленных скрещиваниях мы нередко сталкиваемся с различной силы репродуктивными барьерами, которые проявляются в частичной стерильности пыльцы и семяпочек у гибридов первого поколения, а иногда и к нарушениям их пигментации и недоразвитию листьев и корней. Посредством генетического анализа с использованием молекулярных CAPS-маркеров и получением серии рекомбинантных инбредных линий мы выяснили, что у гороха такие барьеры как правило связаны с конфликтом геномов клеточного ядра и пластид. Совместив генетический анализ с высокопроизводительным секвенированием геномов клеточных органелл, нам удалось связать такой конфликт с несовместимостью белковых субъединиц, входящих в сложный ферментный комплекс – гетеромерную форму ацетил-коА карбоксилазы, ответственный за начальные стадии синтеза жирных кислот, одна из которых, AccD, кодируется геномом пластид, а остальные – в ядре. Проявления конфликта возникают, если субъединица, AccD, кодируемая в пластидном геноме, несовместима с молекулами, кодируемыми в ядре, из которых мы зафиксировали участие в конфликте субъединиц AccA и BccP, но скорее всего в некоторых случаях вовлекаются и иные. Поскольку клеточные органеллы наследуются в основном по материнскоей линии, такое бывает, если гибридное растение получает от отца ядерные гены соответствующих белков, продукты которых несовместимые с продуктами пластидного гена матери. Однако проявления конфликта часто бывают мозаичными, так что некоторые части аномального гибридного растения оказываются нормальными. Nакое случается вследствие того, что в оплодотворенную яйцеклетку попадает незначительное количество отцовских пластид, а в условиях конфликта они приобретают преимущество (так как кодируют белок, совместимый с отцовскими же белками, кодируемыми в ядре) и в некоторых частях растения составляют большинство пластид, или же все пластиды оказываются отцовскими. Основное, успешно завершенное исследование, выявившие участие одного пластидного и двух ядерных генов, кодирующих суъбединицы гетеромерной ацелил-коА карбоксилазы, было проведено с использованием линий VIR320 дикого подвида Pisum sativum subsp. elatius и тестерной линии WL1238, представляющей культурный подвид P. sativum subsp. sativum. В настоящее время мы изучаем генетическую основу репродуктивного барьера в скрещиваниях с другими дикими представителями рода, которая, по предварительным данным, имеет свои особенности.

     

  2. Изучение филогеографии диких представителей рода горох Pisum L. Использование генетического разнообразия дикорастущих сородичей культурного гороха как возможных доноров хозяйственно полезных качеств имеет важное значение для селекции. Дикие представители рода горох и вида посевной (Pisum sativum L.) занимают огромный ареал, включающий все Средиземноморье и Переднюю Азию, от Португалии на западе до Туркменистана на Востоке и от Нормандии на севере до Марокко на юге. Однако на этой территории дикий горох редок, а его популяции обычно ничтожны по размеру, включая от нескольких сотен до нескольких десятков растений. При этом растения из разных популяций отличаются большим разнообразием внешних признаков без каких-либо очевидных географических закономерностей. Поскольку признаки, ценные для селекции, как правило, не имеют внешних проявлений, для их выявления первоначально следует разделить все многообразие дикого гороха на основные эволюционные линии с тем, чтобы в первую очередь исследовать небольшое количество представителей, максимально неродственных друг другу и представляющих основное генетическое разнообразие внутри рода. Поскольку внешние признаки дикого гороха не дают возможности выделить такие линии, в целях выяснения эволюционных отношений различных образцов целесообразно прибегнуть к методам молекулярной филогении. Мы собрали внушительную коллекцию дикого гороха и предприняли реконструкцию эволюционной истории различных образцов на основании последовательностей ДНК одного из ядерных генов. На основе этой реконструкции мы выбрали 64 из них и расшифровали полные геномы их пластид и митохондрий. Если филогенетические деревья, основанные на ядерном гене и на полных геномах пластид в целом соответствовали друг другу, то дерево, построенное на основе геномов митохондрий отличалось от них несколькими весьма очевидными несовпадениями. Налицо оказался ряд случаев вопиющего несоответствия эволюционных деревьев, построенных на основании геномов двух типов клеточных органелл, этими геномами обладающих – пластид и митохондрий, то есть эволюционная история пластид и митохондрий оказалась различна, хотя они суть органеллы одной и той же клетки. Более того, ближайшими родственниками культурного гороха в отношении пластидных и митохондриальных геномов оказались разные наборы диких образцов. Как же такое возможно? Как следует из наших исследований, описанных в предыдущем разделе, при некоторых отдаленных скрещиваниях гороха вследствие конфликта ядра и цитоплазмы возникают ситуации, когда митохондрии наследуются по материнской, а пластиды – по отцовской линии. Это может объяснить несоответствие эволюционных историй пластид и митохондрий в роде Горох, если допустить, что в ходе его эволюции имело место несколько событий гибридизации между не вполне родственными родительскими формами, сопровождающиеся конфликтом ядра и цитоплазмы. Этот конфликт оказал заметное влияние на эволюцию представителей рода Горох. Возможно, такое явление имеет общий характер и сопровождало эволюцию и других растений.

     

и.о. зав. лаб., д.б.н. О.Е.Костерин.


немного информации...

Научный штат:

В лаборатории работали:

Основные публикации:
(перечислены начиная с 1989 г.)

2023

  • Shatskaya, N.V., Bogdanova, V.S., Kosterin, O.E., Vasiliev, G.V. 2023. New insights into plastid and mitochondria evolution in wild peas (Pisum L.). // Diversity, vol. 14, 256. https://doi.org/10.3390/d15020216
  • Kosterin, O.E. 2023. Natural range, habitats and populations of wild peas (Pisum L.) // Genetic Resources and Crop Evolution, el. pub. ahead of print https://doi.org/10.1007/s10722-023-01544-5

    2022

  • Костерин О.Э. 2022. Основы генетики: учебник. 2-е изд., перераб. Новосибирск: ИПЦ НГУ, 650 с. https://doi.org/10.25205/978-5-4437-1323-6
  • Mglinets, A.V., Bogdanova, V.S., Kosterin, O.E. 2022. Identification of the gene coding for seed cotyledon albumin SCA in the pea (Pisum L.) genome. // Vavilovskii Zhurnal Genetiki i Selektsii = Vavilov Journal of Genetics and Breeding, Vol. 26, Issue 4, p. 359-364. https://doi.org/10.18699/VJGB-22-43
  • Solovyev, V.I., Dubatolov, V.V., Vavilova, V.Y., Kosterin, O.E. 2022. Estimating range disjunction time of the Palaearctic Admirals (Limenitis L.) with COI and histone H1 genes. // Organisms Diversity & Evolution. https://doi.org/10.1007/s13127-022-00565-9
  • Onishko, V.V., Kosterin, O.E., Blinov, A.G., Sukhikh, I.S., Ogunleye, A.T., Schroeter, A. 2022. Aeshna soneharai Asahina, 1988, stat. rev., bona species – an overlooked member of European fauna? (Odonata: Aeshnidae) // Odonatologica, Vol. 5, No. 1-2, p. 111-145. https://doi.org/10.5281/odon.v51i1-2.a6
  • Shekhovtsov S.V., Shekhovtsova I.N., Kosterin O.E. 2022. Genotyping-by-sequencing analysis shows that Siberian lindens are nested within Tilia cordata Mill. // Diversity 2022, 14, 256. https://doi.org/10.3390/d14040256

    2021

  • Bogdanova, V.S., Shatskaya, N.V., Mglinets, A.V., Kosterin, O.E., Vasiliev, G.V. 2021. Discordant evolution of organellar genomes in peas (Pisum L.). // Molecular Phylogenetics and Evolution, Vol. 160, 107136. https://doi.org/10.1016/j.ympev.2021.107136
  • Kosterin O.E., Bogdanova V.S. 2021. Reciprocal compatibility within the genus Pisum L. as studied in F1 hybrids: 4. Crosses within P. sativum L. subsp. elatius (Bieb.) Aschers. et Graebn. // Genetic Resources and Crop Evolution Vol. 68. No. 6. P. 2565-2590. https://doi.org/10.1007/s10722-021-01151-2

    2020

  • Kosterin O.E., Bogdanova V.S. 2020. Reciprocal compatibility within the genus Pisum L. as studied in F1 hybrids: 3. Crosses involving P. abyssinicum A. Br. // Genetic Resources and Crop Evolution Vol. 67. No. 4. P. 967-983. https://doi.org/10.1007/s10722-020-00895-7
  • Bogdanova V.S. 2020. Genetic and molecular genetic basis of nuclear-plastid incompatibilities. // Plants, Vol. 9, Issue, pi 23. https://doi.org/10.3390/plants9010023
  • Kosterin O.E., Bogdanova V.S., Mglinets A.V. 2020. Wild pea (Pisum sativum L. subsp. elatius Aschers. et Graebn. s. l.) at the periphery of its range: Zagros Mountains. // Vavilov Journal of Genetics and Breeding Vol. 24. No. 1. P. 60-68. https://doi.org/10.18699/VJ20.596
  • Агафонов А.В., Шабанова (Кобозева) Е.В., Асбаганов С.В., Мглинец А.В., Богданова В.С. 2020. Выявление геномного состава аллополиплоидных видов рода Elymus (Poaceae: Triticeae) Азиатской России с помощью CAPS-анализа. // Вавиловский журнал генетики и Селекции, Т. 24, вып. 2, с. 115-120 https://doi.org/10.18699/VJ20.606

    2019

  • Shatskaya N.V., Bogdanova V.S., Kosterin O.E., Vasiliev G.V., Kimeklis A.K., Andronov E.E., Provorov N.A. 2019. The plastid and mitochondrial genomes of Vavilovia formosa (Stev.) Fed. and the phylogeny of related legume genera. // Vavilov Journal of Genetics and Breeding Vol. 23. No. 8. P. 972-980. https://doi.org/10.18699/VJ19.574

    2018

  • Bogdanova, V.S., Mglinets, A.V., Shatskaya, N.V., Kosterin, O.E., Solovyev, V.I., Vasiliev, G.V. 2018. Cryptic divergences in the genus Pisum L. (peas), as revealed by phylogenetic analysis of plastid genomes. // Molecular Phylogeny and Evolution. Vol. 129. P. 280-290.
  • Kosterin, O.E., Bogdanova, V.S. 2018. Obscuring the routes: confused data cannot reveal phylogeography of pea crop wild relartives (refutation to ‘Genomic diversity and macroecology of the crop wild relatives of domesticated pea’ by Smykal et al. 2017) // Acta Biologica Sibirica. Vol. 4. Issue 3. P. 66-68.

    2017

  • Zaytseva O.O., Bogdanova V.S., Mglinets A.V., Kosterin O.E. 2017. Refinement of the collection of wild peas (Pisum L.) and search for the area of pea domestication with a deletion in the plastidic psbA-trnH spacer // Genetic Resources and Crop Evolution. Vol. 64. Issue 6. P. 1417-1430.
  • Костерин О.Э. 2017. Горох абиссинский (Lathyrus schaeferi Kosterin nom. nov. pro Pisum abyssinicum A. Br.) – проблематичный таксон. // Вавиловский журнал генетики и селекции. – Т. 21. – № 2. – С. 158-169.
    Английская версия: Kosterin, O.E. 2017. Abyssinian pea (Lathyrus schaeferi Kosterin pro Pisum abyssinicum A. Br.) – a problematic taxon. // Acta Biologica Sibirica. Vol. 3. No. 3. P. 97-110.
  • Kosterin, O.E. 2017. On three cultivated subspecies of pea (Pisum sativum L.).// Vavilovskii Zhurnal Genetiki i Selektsii = Vavilov Journal of Genetics and Beeding. Vol. 21, Issue 6, p. 694-700.
  • Ilinsky, Y., Kosterin, O.E. 2017. Molecular diversity of Wolbachia in Lepidoptera: prevalent allelic content and high recombination of MLST genes. // Molecular Phylogenetics and Evolution. Vol. 109. P. 164-179.

    2016

  • Костерин О.Э. 2016. Основы генетики. Часть 2. Хромосомные перестройки, полиплоидия и анеуплоидия, мобильные генетические элементы и генетическая трансформация, генетика количественных признаков и популяционная генетика. Новосибирск: РИЦ НГУ, 246 с. Phylogenetics and Evolution. Vol. 109. P. 164-179.

    2015

  • Bogdanova VS, Zaytseva OO, Mglinets AV, Shatskaya NV, Kosterin OE and Vasiliev GV. 2015 Nuclear-cytoplasmic conflict in pea (Pisum sativum L.) is associated with nuclear and plastidic candidate genes encoding Acetyl-CoA carboxylase subunits. // PLoS ONE 10(3): e0119835. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0119835
  • Kosterin O.E., Bogdanova V.S.. 2015. Reciprocal compatibility within the genus Pisum L. as studied in F1 hybrids: 1. Crosses involving P. sativum L. subsp. sativum. // Genetic Resources and Crop Evolution Vol. 62. No. 5. P. 691-709.
  • Zaytseva O.O., Gunbin K.V., Mglinets A.V., Kosterin O.E. 2015. Divergence and population traits in evolution of the genus Pisum L. as reconstructed using genes of two histone H1 subtypes showing different phylogenetic resolution. // Gene, Vol. 556. – P. 235-244.
  • Костерин О.Э. 2015. При царе горохе (Pisum sativum L.): непростая судьба первого генетического объекта. // Вавиловский журнал генетики и селекции. Т. 19. №. 1. С. 13-26.<
    Английская версия: Koserin O.E. 2016. Under the reign of the Pea King (the difficult fate of the first genetical object. // Russian Journal of Genetics: Applied Research. Vol. 6. No. 1. P. 1-14.
  • Костерин О.Э. 2015. Перспективы использования диких сородичей в селекции гороха (Pisum sativum L.). // Вавиловский журнал генетики и селекции. Т. 19. № 2. С. 154-164.
    Английская версия: Kosterin O.E. 2016. Prospects of the use of wild relatives for pea breeding. // Russian Journal of Genetics: Applied Research. Vol. 6. No. 3. P. 233-243.
  • Костерин О.Э. 2015. Основы генетики. Часть 1. Основные понятия, определение пола и смежные вопросы, генетическая рекомбинация. Новосибирск: РИЦ НГУ, 410 с.
  • Solovyev V.I., Bogdanova V.S., Dubatolov V.V., Kosterin O.E. 2015. Range of a Palearctic uraniid moth Eversmannia exornata (Lepidoptera: Uraniidae: Epipleminae) was split in the Holocene, as evaluated using histone H1 and COI genes with reference to the Beringian disjunction in the genus Oreta (Lepidoptera: Drepanidae). // Organisms Diversity & Evolution. Vol. 15. No. 2. P. 285-300.
  • Костерин О.Э. 2015. Перспективы использования диких сородичей в селекции Solovyev V.I., Ilinsky Y., Kosterin O.E. 2015. Genetic integrity of four species of Leptidea (Pieridae, Lepidoptera) as sampled in sympatry in West Siberia // Comparative Cytogenetics. Vol. 9. Iss. 3. P. 299-324. https://doi.org/10.3897/CompCytogen.v9i3.4636.

    2014

  • Bogdanova V.S., Kosterin O.E., Yadrikhinskiy A.K. 2014. Wild peas vary in their cross-compatibility with cultivated pea (Pisum sativum subsp. sativum L.) depending on alleles of a nucoear-cytoplasmic incompatibility locus . // Theoretical and Applied Genetics 127: 1163-1172.
  • Костерин О.Э. 2015. Перспективы использования диких сородичей в селекции Kosterin O.E. The lost ancestor or the broad bean (Vicia faba L.) and the origin of plant cultivation in the Near East. // Вавиловский журнал генетики и селекции. 2014. Т. 18. № 4-1. С. 831-840.
  • Kosterin OE, Bogdanova VS. 2014. Efficiently of hand pollination in different pea (Pisum) species and subspecies. The Indian Journal of Genetics and Plant Breeding 74: 50-55.
  • Костерин О.Э., Богданова В.С. 2014. Стадия развития цветка, оптимальная для искусственного опыления, варьирует в роде Горох (Pisum L.). // Вавиловский журнал генетики и селекции. – Т. 18 – №3. - С. 478-485.
  • Мглинец А.В., Соколов В.А., Петрова Е.А., Горошкевич С.Н. Сравнительное изучение первичной структуры фрагмента гена LEA у Pinus sibirica Du Tour и Pinus pumila (Pallas) Regel. // Генетика, Том 50, вып.2, с. 167–171.
    English version: Mglinets A.V., Sokolov V.A., Petrova E.A., Goroshkevich S.N. Comparative sequence analysis of the LEA gene fragment in Pinus sibirica Du Tour and Pinus pumila (Pallas) Regel. // Russian Journal of Genetics, Vol. 50, No. 2, pp. 149–152.

    2012

  • Bogdanova, V.S., E.R. Galieva, A.K. Yadrikhinskiy, O.E. Kosterin. 2012. Inheritance and genetic mapping of two nuclear genes involved in nuclear-cytoplasmic incompatibility in peas (Pisum sativum L.). // Theor. Appl. Genet., Vol. 124, pp. 1503-1512.
  • Zaytseva O.O., Bogdanova V.S, Kosterin O.E. 2012. Phylogenetic reconstruction at the species and intraspecies levels in the genus Pisum (L.) (peas) using a histone H1 gene. // Gene, Vol. 504, pp. 192-202.
  • Kosterin, O.E., V.S. Bogdanova, A.A. Kechin, O.O. Zaytseva, A.K. Yadrikhinskiy. 2012. Polymorphism in a histone H1 subtype with a short N-terminal domain in three legume species (Fabaceae, Fabaeae). // Molecular Biology Repots, Vol. 39, pp. 10681-10695.

    2011

  • Ядрихинский А.К., Богданова В.С. 2011. Ядерно-цитоплазматический конфликт при скрещивании подвидов гороха контролируется аллелями ядерного гена третьей группы сцепления. // Доклады Академии Наук,Т. 441, Вып. 3, с. 426–429.
    English version: Yadrikhinskiy A.K.,Bogdanova V.S. 2011. Nuclear-Cytoplasm Conflict in Crosses of Pea Subspecies is Controlled by Alleles of a Nuclear Gene on Linkage Group III. // Doklady Biological Sciences, Vol. 441, pp. 392–395.
  • Smykal P., Kenicer G., Flavell A.J., Corander J., Kosterin O., Redden R.J., Ford R., Coyne C.J., Maxted N., Ambrose M.J. and Ellis N.T.H. 2011. Phylogeny, phylogeography and genetic diversity of the Pisum genus. // Plant Genetic Resources: Characterization and Utilization, vol. 2010, pp. 1-15.

    2010

  • Kosterin O.E., Zaytseva O.O., Bogdanova V.S. , Ambrose M. 2010. New data on three molecular markers from different cellular genomes in Mediterranean accessions reveal new insights into phylogeography of Pisum sativum L. subsp. elatuis (Beib.) Schmahl. // Genetic Resources abn Crop Evolution. Vol. 57. P. 733-739.
  • Bogdanova VS, Yadrikhinskiy AK. 2010. Mapping the st locus in respect to three molecular markers on Linkage Group III. // Pisum Genetics, Vol. 42, p.41-42.

    2009

  • Bogdanova V.S., Galieva E.R., Kosterin O.E. 2009. Genetic analysis of nuclear-cytoplasmic incompatibility in pea associated with cytoplasm of an accession of wild subspecies Pisum sativum subsp. elatius (Bieb.) Schmahl. // Theoretical and Applied Genetisc, Vol. 118, Issue 4, P. 801-809.
  • Kosterin O.E., Galieva E.R., Bogdanova V.S. 2009. The first record of tetrasomy in pea (Pisum sativum L.). // Euphytica, Vol. 166, p. 109-121.
  • Костерин О.Э., Колесникова Т.Д. 2009. О чем писал Дарвин? // Информационный вестник ВОГиС, Vol. 13, Issue 2, p. 448-479.
  • Богданова В.С, Галиева Э.Р. 2009. Нарушения мейоза как проявление ядерно-цитоплазматической несовместимости при скрещивании подвидов посевного гороха. // Генетика, Т. 45, вып. 5, с. 711-716.
    English version: Bogdanova V.S., Galieva, E.R. 2009. Meiotic abnormalities as expression of nuclear–cytoplasmic incompatibility in crosses of Pisum sativum subspecies. // Russian Journal of Genetics, Vol. 45, No. 5, pp. 623–627

    2008

  • Kosterin, O.E., Bogdanova V.S. 2008. Relationship of wild and cultivated forms of Pisum L. as inferred from an analysis of three markers, of the plastid, mitochondrial and nuclear genomes. Genetic Resources and Crop Evolution 55 (5) 735-755.
  • Костерин О.Э., Богданова В.С., Горель Ф.Л., Бердников В.А. Трисомики гороха (Pisum sativum L.) демонстрируют легкий ответ на отбор на повышение плодовитости. // Докл. Акад. Наук 2008, т. 423 (3): 417-420.
  • Костерин О. Э. 2008. Общая биология. Лекции для психологов. Новосибирск: Новосибирский государственный университет - 386 с.

    2007

  • Bogdanova, V. S., O. E. Kosterin, V. A. Berdnikov. 2007. Phenotypic effect of substitution of allelic variants for a histone H1 subtype specific for growing tissues in the garden pea (Pisum sativum L.). // Genetica, Vol. 130, Iss. 1, p. 61-72.
  • Bogdanova V.S. 2007. Inheritance of organelle DNA markers in a pea cross associated with nuclear-cytoplasmic incompatibility. // Theoretical and Applied Genetics, Vol, 114, Issue 2, p. 333-339.
  • Костерин О. Э. 2007. Дарвинизм как частный случай "бритвы Оккама". // Философия науки. Т. 4 (35), с. 73-103.
  • Костерин О. Э. 2007. Дарвинизм как частный случай "Бритвы Оккама". // Информационный вестник ВОГиС. Т. 11, вып. 2, С. 416-431.
  • Bogdanova, V. S., O. E. Kosterin. 2007. Hybridization barrier between Pisum fulvum Sibth et Smith and P. sativum L. is partly due to nuclear-chloroplast incompatibility. Pisum Genetics 39: 8-9.
  • Костерин О.Э., Богданова В.С., Розов С.М. 2007. Природа Академгородка в исследованиях роли генов гистона Н1 в макро- и микроэволюции // Природа Академгородка: 50 лет спустя. отв. ред. И. Ф. Жимулев., Новосибирск: Изд-во СО РАН, с. 201-209.

    2006

  • Богданова В.С., Костерин О.Э. 2006. Случай аномального наследования хлоропластов в скрещиваниях посевного гороха с участием одной из диких форм. // Доклады Академии Наук, т.406, N2, с. 256-259.
  • Bogdanova V.S., Kosterin O.E. 2006. A mitochondrial DNA marker frequently found in wild peas. // Pisum Genetics, Vol. 38, p. 1-2.
  • Mazzarelli J.M., White P., Gorski R., Brestelli J., Pinney D.F., Arsenlis A., Katokhin A.A., Belova O., Bogdanova V., Elisafenko E., Gubina M., Nizolenko L., Perelman P., Puzakov M., Shilov A., Trifonoff V., Vorobjeva N., Kolchanov N., Kaestner K.H., Stoeckert Jr C.J. 2006. Novel genes identified by manual annotation and microarray expression analysis in the pancreas. // Genomics, Vol. 88, Iss. 6, p. 752-761.

    2005

  • Berdnikov V.A., Gorel, F.L. 2005. A mutation, tl2, in pea (Pisum sativum L.) affects leaf development only in the heterozygous state. // Theoretical and Applied Genetics, Vol. 110, Issue 6, p. 1086-1091
  • Bogdanova V.S, Lester D.R., Berdnikov V.A., Andersson I. 2005. Structure of allelic variants of subtype 5 of histone H1 in pea Pisum sativum L. // Heredity, Vol. 94, Issue 6, p. 582-588.
  • Bogdanova, V.S., Kosterin O.E. 2005. A chloroplast DNA marker frequently found in wild peas. // Pisum Genetics, Vol. 37, p. 40-42.

    2004

  • Бердников В.А. 2004. Отбор на скорость эволюции как один из факторов, определяющих строение многоклеточных. // Экологическая генетика, Т. с. 59-66.
  • Бердников В.А. 2004. Сложность как мерило эволюционного прогресса. // Наука из первых рук. Том 0, стр. 71-77
  • Бердников В.А, Горель Ф.Л. 2004. Tendril-less (tl2) - один из генов, наделяющих горох Pisum sativum L. способностью к лазанию. // Экологическая генетика, Т. 2, вып. 2, с. 22-28.
  • Trusov, Y., Bogdanova V.S., Berdnikov V.A. 2004. Evolution of regular zone of histone H1 in Fabaceae plants. // Journal of Molecular Evolution, Vol. 59, p. 546-555.
  • Berdnikov V.A., Gorel F.L. 2004. Combination of mutations sil and ins2 can cause conversion of stipules into compound leaves. // Pisum Genetics, Vol. 36, p.3-5.

    2003

  • Berdnikov, V.A., Gorel, F.L., Kosterin, O.E., Bogdanova, V.S. 2003. Tertiary trisomics in the garden pea as a model of B chromosome evolution in plants. // Heredity, Vol. 91, pp. 577-583.
  • Berdnikov, V. A., V. S. Bogdanova, F. L. Gorel, O. E. Kosterin, Y. A. Trusov, 2003. Large changes in the structure of the major histone H1 subtype result in small effects on quantitative traits in legumes. // Genetica. 119 (2):167-82.

    2002

  • Berdnikov, V. A., Kosterin, O. E., Bogdanova, V. S. 2002. Mortality of pollen grains may result from errors of meiosis: study of pollen tetrads in Typha latifolia L. // Heredity, Vol. 89. Issue 5, p. 358-362.
  • Gorel, F. L., Berdnikov, V. A., Kosterin, O. E. 2002. Mutation air dots (adt) with slight unli
  • Dudnikov A.J., Gorel F.L, Berdnikov V.A. 2002. Chromosome location of histone H1 genes in common wheat. // Cereal Research Communications, Vol. 30, p. 55-61.

    2001

  • Бердников В. А., Горель Ф. Л., Костерин О. Э., Богданова В. С. 2001. Происхождение B-хромосом у растений. Теоретический и экспериментальный подходы. // Эволюционная билогия. Том 1. Материалы конференции "Проблема вида и видообразования", г. Томск, 3-6 октября 2000 г. - Томск - Томский государственный университет - с. 163-178.
  • Berdnikov, V.A., Gorel, F.L. 2001. Tl2, a new locus resembling Tl in its action. // Pisum Genetics, Vol. 33, p. 1-4.
  • Bogdanova, V.S., Berdnikov, V.A. 2001. Observation of the phenomenon resembling hybrid dysgenesis in a wild pea subspecies Pisum sativum ssp. elatius. // Pisum Genetics, Vol. 33, p. 5-8.
  • Gorel, F.L. Berdnikov, V.A. 2001. Coiling shoot (csh), a new mutation affecting shoot gravitropism. // Pisum Genetics, Vol. 33, p. 9-10.

    2000

  • Berdnikov, V.A., Gorel', F.L., Kosterin, O.E. 2000. A new allele of crd disturbs development of the compound leaf. // Pisum Genetics, Vol. 32, p. 6-8.
  • Berdnikov, V.A., Gorel, F.L., Bogdanova, V.S., Kosterin, O.E. 2000. Interaction of a new leaf mutation ins-2 with af, uni=tac and tl. // Pisum Genetics, Vol. 32, p. 9-12.
  • Berdnikov, V.A., Gorel, F.L., Bogdanova, V.S., Kosterin, O.E. 2000. New mutations in the linkage group V have provided stable trisomic lines of pea. // Pisum Genetics, Vol. 32, p. 13-15.
  • Bogdanova, V.S., Berdnikov, V.A. 2000. A study of potential ability for cross-pollination in pea originating from different parts of the world // Pisum Genetics, Vol. 32, p. 16-17.
  • Bogdanova, V. S., Kosterin, O. E., Berdnikov, V. A. 2000. Dominant alleles of the locus Tl may differ in their strength. // Pisum Genetics, Vol. 32, p. 18-19.
  • Gorel', F.L, Kosterin, O.E., Berdnikov, V.A. 2000. Linkage relationship between the loci Twt and Vam. // Pisum Genetics, Vol. 32, P. 57-58.

    1999

  • Berdnikov V.A. 1999. Evolution and Progress. Pensoft, Sofia-Moscow, 136 pp.
  • Berdnikov V.A., Gorel F.L., Bogdanova V.S., Kosterin O.E., Trusov Y.A., Rozov S.M. 1999. Effect of a substitution of a short chromosome segment carrying a histone H1 locus on expression of the homeiotic gene Tl in heterozygote in the garden pea Pisum sativum L. // Genetical Research, Vol. 70, P. 93-109.
  • Berdnikov V.A., Gorel F.L., Kosterin O.E. 1999. Two simultaneously induced lethal mutations provide a system for automatic reproduction of a heterozygote for the Hammarlund translocation. // Pisum Genetics, Vol. 31, p. 1-4.
  • Gorel F.L., Berdnikov V.A., Kosterin O.E..1999. A new xantha-type mutation golden (gld) on the short arm of chromosome 5. Pisum Genetics, Vol. 31, P. 5-8.
  • Kosterin O.E. 1999. A floral homeiotic mutation affecting B function of florogenesis control in the pea. // Pisum Genetics, Vol. 31, p. 9-10.
  • Kosterin, O.E., Berdnikov V.A., and F.L. Gorel. 1999. EMS-induced lethal in the vicinity of the locus lf. // Pisum Genetics, Vol. 31, p. 11-12.
  • Kosterin O.E., Pukhnacheva N.V., Gorel F.L., Berdnikov V.A. 1999. Location of the breakpoints of four reciprocal translocations involving linkage group V and their influence on recombination distances between neighbouring markers. // Pisum Genetics, Vol. 31, p. 13-20.
  • Kosterin O.E., Berdnikov V.A., Gorel F. L. 1999. Equations for estimation of recombination fraction between a marker and a sporophytic lethal in F2 progenies with the maximum likelihood method. // Pisum Genetics, Vol. 31, p. 33.
  • Kosterin O.E., Pukhnacheva N.V., Gorel F.L., Berdnikov V.A. 1999. Equations for estimation of recombination fraction between a marker and a translocation breakpoint. // Pisum Genetics, Vol. 31, p. 33-34.
  • Rozov, S.M., Kosterin O., Borisov A.Y., Tsyganov V. 1999. The histry of the pea gene maps: last revolutions and the new symbiotic genes. // Pisum Genetics, Vol. 31, p. 55-56.

    1998

  • Weeden N.F., Ellis T.H.N., Timmerman-Vaughan G.M., Swecicki W.K., Rozov S.M., Berdnikov V.A. 1998. A consensus linkage map for Pisum sativum. // Pisum Genetics, Vol. 30, p. 1-4.
  • Gorel F.L., Rozov S.M., Berdnikov V.A. 1998. Mapping the locus coch. // Pisum Genetics, Vol. 30, p. 9-11.

    1997

  • Rozov S.M., Gorel F.L., Berdnikov V.A. 1997. Mapping of the py (precocious yellowing) locus in linkage group V. // Pisum Genetics, Vol. 29, p. 18-19
  • Rozov S.M., Gorel F.L., Kosterin O.E., Berdnikov V.A. 1997. An new homeiotic gene, biv, affects flower and inflorescence structures, and display linkage with d. // Pisum Genetics, Vol. 29, p. 24-25.
  • Rozov S.M., Gorel F.L., Berdnikov V.A.. 1997. New genes located on the d linkage segment: brac and wlo2. // Pisum Genetics, Vol. 29, p. 26.
  • Bogdanova V.S., Trusov Y.A., Berdnikov V.A. 1997. Genetic instability in the histone H1 locus of pea (Pisum sativum L.). // Pisum Genetics, Vol. 29, p. 27-31
  • Gorel F.L., Berdnikov V.A., Rozov S.M., Kosterin O.E. 1997. Linkage relationships of loci d, Pur and Astr. // Pisum Genetics, Vol. 29, p. 32-33.
  • Kosterin, O.E., Berdnikov V.A., Rozov S.M., Gorel F.L. 1997. A probable codominant allele of the locus bt with a striking effect on the pod. // Pisum Genetics, Vol. 29, p. 34-38.
  • Gorel F.L., Rozov S.M., Berdnikov V.A. 1997. The a2 gene is in linkage group III. // Pisum Genetics, Vol. 29, p. 39.
  • Skripkina T.A. 1997. A new allele at the locus nod4. // Pisum Genetics, Vol. 29, p. 40-41.
  • Berdnikov V.A., Gorel F.L., Kosterin O.E., Rozov S.M. 1997. A lathyroides-phenotyoe mutation affecting both foliage and flower structures. // Pisum Genetics, Vol. 29, p. 42-43.
  • Rozov S.M., Gorel F.L., Berdnikov V.A. 1997. New alleles at the am1 and red loci on linkage group IA. // Pisum Genetics, Vol. 29, p.44.
  • Borisov A.Y., Rozov S.M., Tsyganov V.E., Morzhina E.V., Lebsky V.K., Tikhonovich I.A. 1997. Sequential functioning of Sym-13 and Sym-31, two genes affecting symbiosome development in root nodules of pea (Pisum sativum L.). // Molecular and General Genetics, Vol. 254, p. 592-598.

    1996

  • Trusov Y.A., Dear P.H. 1996. A molecular clock based on the expansion of gene families. // Nucleic Acids Research, Vol. 24, p. 995-999.

    1995

  • Bogdanova V.S., Y.A. Trusov and O.E. Kosterin. Further data on the genes controlling anthocyanin pigmentation in the pea. // Pisum Genetics, Vol. 27, p. 1-4. Kosterin O.E., Bogdanova V.S., Gorel' F.L., Berdnikov V.A. 1995. Inheritance of a pollen protein and a probable case of inversion in the pea chromosome corresponding to linkage group I // Pisum Genetics, Vol. 27, p. 5-8.
  • Paruvangada V.G., Weeden N.F., Cargnoni T.Yu., Gorel' F.L., Frew T., Timmerman-Vaughan G.M., McCallum J. 1995. Enod2 exhibits linkage with a (linkage group IA) and Fum (linkage group II). // Pisum Genetics, Vol. 27, p. 12-13.
  • Temnykh S.V., Gorel’ F.L., Berdnikov V.A., Weeden N.F. 1995. Chromosomes 2 and 6 are involved in the Twt-translocation. // Pisum Genetics, Vol. 27, p.23-24.
  • Kosterin, O.E. 1995. Evaluation of linkage in F2 progenies by the chi-square criterion with codominant genes involved. // Pisum Genetics, Vol. 27, p. 31-32.

    1994

  • Bogdanova V.S., Rozov S.M., Trusov Y.A., Berdnikov V.A. 1994. Phenotypic effect of substitutions of short chromosomal segments containing different alleles of histone H1 genes in garden pea (Pisum sativum L.). // Genetical Research, Vol. 64, p. 35-41.
  • Kosterin O.E., Bogdanova V.S., Gorel F.L., Rozov S.M., Trusov Y.A., Berdnikov V.A.. 1994. Histone H1 of the garden pea (Pisum sativum L.): composition, developmental changes, allelic polymorphism and inheritance. // Plant Science, Vol. 101, p. 189-202.
  • Berdnikov V.A., Gorel F.L., Temnykh S.V. 1994. Gene Twt (Twisted tendrills) decoupled from the translocation breakpoint became a convenient dominant marker on chromosome 1. Pisum Genetics, Vol. 26, p. 9-10.
  • Gorel' F.L., Berdnikov V.A., Temnykh S.V. 1994. A deletion covering the tl locus in Pisum sativum. // Pisum Genetics, Vol. 26, p. 16-17.
  • Rozov S.M., Borisov A.Y., Tsyganov V.E. 1994. Further evidence that the mutant Fix gene in line Spint-2Fix is in pea linkage group 3. // Pisum Genetics, Vol. 26, p. 24-25.
  • Rozov S.M., Gorel' F.L. 1994. Mapping of the chlorophyll mutation vam of the variomaculata-type in the linkage group I of pea. // Pisum Genetics, Vol. 26, p. 26-27.
  • Trusov Y.A., Bogdanova V.S., Berdnikov V.A. 1994. Recombination within the complex locus His26 containing genes for five histone H1 subtypes in pea. // Pisum Genetics, Vol. 26, p. 34-35.
  • Udalyeva S.G., Berdnikov V.A. 1994. Linkage relationship of genes curl and His1 is conserved in Pisum sativum and P.fulvum. // Pisum Genetics, 1994, Vol. 26, p. 38.
  • Tsyganov V.E., Borisov A.Yu., Rozov S.M., Tikhonovich I.A. 1994. New symbiotic mutants of pea obtained after mutagenesis of line SGE. // Pisum Genetics, Vol. 26, p. 36-37.

    1993

  • Berdnikov, V.A., Kosterin O.E. 1993. Mobilizing selection as a factor in macroevolution. // Genetics, Selection, Evolution, Vol. 25, p. 577-595.
  • Berdnikov V.A., Rozov S.M., Temnykh S.V., Gorel' F.L., Kosterin O.E. 1993. Adaptive nature of interspecies variation of histone H1 in insects. // Journal of Molecular Evolution, Vol. 36, p. 497-507.
  • Berdnikov V.A., Bogdanova V.S., Rozov S.M., Kosterin. O.E. 1993. Geographic patterns of histne H1 allelic frequencies formed in the course of Pisum sativum L. (pea) cultivaion. // Heredity, Vol. 71, p. 199-209.
  • Berdnikov V.A., Gorel’ F.L., Temnykh S.V. 1993. A more precise location of the breakpoints in Hammarlund’s K-line. // Pisum Genetics, Vol. 25, p. 18-21.
  • Kosterin O.E. 1993. Genes a and d may not be in the same linkage group. // Pisum Genetics, Vol. 25, p. 23-26.
  • Kosterin O.E., Rozov S.M. 1993. Mapping of the new mutation blb and the problem of integrity of linkage group 1. // Pisum Genetics, Vol. 25, p. 27-31.
  • Rozov S.M., Temnykh S.V., Gorel’ F.L., Berdnikov V.A. 1993. A new version of pea linkage group 5. // Pisum Genetics, Vol. 25, p. 46-51.
  • Kosterin O.E. 1993. Chromosomal rearrangement in line WL1393. // Pisum Genetics, Vol. 25, p. 71.

    1992

  • Smirnova O.G., Rozov S.M., Kosterin O.E., Berdnikov V.A. 1992. Perchloric acid extractable low-Mr albumins SCA and SAA from cotyledons and seed axes of pea (Pisum sativum L.). // Plant Science, Vol. 82, p. 1-13.
  • Berdnikov V.A., Bogdanova V.S., Gorel F.L., Rozov S.M. 1992. Territorial distribution of histone H1 alleles in a population of Vicia unijuga A. Br. Formed after urbanization of natural habitat. // Canadian Journal of Botany, Vol. 70, p. 1591-1595.
  • Gorel F.L., Berdnikov V.A. 1992. Linkage of loci encoding H1 histone and a coptyledon protein in lentil. Journal of Heredity, Vol. 84, Issue 2, p. 131-134
  • Berdnikov V.A., Trusov Y.A., Bogdanova V.S., Kosterin O.E., Rozov S.M., Nedel'kina S.V., Nikulina Y.N. 1992. The neoplastic pod gene (Np) may be a factor for resistance in pea to the pest Bruchus pisorum L. // Pisum Genetics, Vol. 24, p. 37-39.
  • Gorel F.L., Temnykh S.V., Lebedeva I.P., Berdnikov V.A. 1992. Twisted tendrils (Twt) - a phenotype associated with a translocation involving chromosome 1. // Pisum Genetics, Vol. 24, p. 48-51.
  • Kosterin O.E. 1992. Mapping of the third locus for histone H1 genes in peas. // Pisum Genetics, Vol. 24, P. 56-59.
  • Rozov S.M., Gorel F.L., Berdnikov V.A. 1992. Coch and het are allelic. // Pisum Genetics, Vol. 24, p 82.

    1990

  • Бердников В.А. 1990. Основные факторы макроэволюции. Новосибирск: Наука, Сибирское отделение, 252 с.

    1989

  • Бердников В.А., Богданова В.С., Розов С.М., Костерин О.Э. 1989. Формирование многообразия генов гистона Н1 в ходе культурной эволюции гороха. // Вавиловское наследие в современной биологии, М: Наука, c. 72-89.

    Избранные главы из английского перевода книги В.А. Бердникова "Эволюция и прогресс".

    Pisum Genetics journal.